Biological
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#NLP
#Dataset
#LanguageModel
#Supervised-FineTuning (SFT)
#ReinforcementLearning
#Evaluation
#Reasoning
Issue Date: 2025-09-20 [Paper Note] BioReason: Incentivizing Multimodal Biological Reasoning within a DNA-LLM Model, Adibvafa Fallahpour+, NeurIPS'25 GPT Summary- BioReasonは、DNA基盤モデルと大規模言語モデル（LLM）を統合した新しいアーキテクチャで、複雑なゲノムデータからの生物学的推論を深く解釈可能にする。多段階推論を通じて、精度が88%から97%に向上し、バリアント効果予測でも平均15%の性能向上を達成。未見の生物学的エンティティに対する推論を行い、解釈可能な意思決定を促進することで、AIにおける生物学の進展を目指す。 Comment
#NLP #Dataset #LanguageModel #LLMAgent #Evaluation #read-later #Medical
Issue Date: 2025-09-10 BioML-bench: Evaluation of AI Agents for End-to-End Biomedical ML, Miller+, bioRxiv'25 Comment
Issue Date: 2025-09-20 [Paper Note] BioReason: Incentivizing Multimodal Biological Reasoning within a DNA-LLM Model, Adibvafa Fallahpour+, NeurIPS'25 GPT Summary- BioReasonは、DNA基盤モデルと大規模言語モデル（LLM）を統合した新しいアーキテクチャで、複雑なゲノムデータからの生物学的推論を深く解釈可能にする。多段階推論を通じて、精度が88%から97%に向上し、バリアント効果予測でも平均15%の性能向上を達成。未見の生物学的エンティティに対する推論を行い、解釈可能な意思決定を促進することで、AIにおける生物学の進展を目指す。 Comment
HF:
https://huggingface.co/collections/wanglab/bioreason-683cd17172a037a31d208f70
pj page:
https://bowang-lab.github.io/BioReason/
元ポスト:
#NLP #Dataset #LanguageModel #LLMAgent #Evaluation #read-later #Medical
Issue Date: 2025-09-10 BioML-bench: Evaluation of AI Agents for End-to-End Biomedical ML, Miller+, bioRxiv'25 Comment
元ポスト:
Biomedicalドメインにおける24種類の非常に複雑でnuancedな記述や画像の読み取りなどを含む実タスクによって構成される初めてのAgenticベンチマークとのこと。